絲狀真菌叢枝菌

時(shí)間：2014-08-21作者：深圳市安必勝科技有限公司瀏覽：81

來(lái)源：深圳市安必勝科技有限公司 轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處

MOBIO的技術(shù)團(tuán)隊(duì)參加了芝加哥舉行的*四屆阿爾貢土壤宏基因組學(xué)會(huì)議，其中較熱的話題就是絲狀真菌。技術(shù)部的熱線響個(gè)不停，來(lái)電有許多咨詢?nèi)绾翁崛〗z狀真菌DNA和RNA，貌似全宇宙都在關(guān)心絲狀真菌。所以很值得在技術(shù)文章里頭占一篇只之地。

真菌是種很有趣的微生物。有哪個(gè)物種的大小既能是一個(gè)細(xì)胞，也能長(zhǎng)到迄今為止已知地球上較大的生物體，足足占地4平方英里（在俄勒岡州的藍(lán)嶺）？對(duì)的，它是就真菌。真菌無(wú)處不在，有些是有益的，有些很美味，有些則劇毒！無(wú)論你對(duì)它有什么樣的看法，都不妨礙它們作為較頑強(qiáng)的微生物。

是什么造就它們的頑強(qiáng)？

是什么讓它們那么難裂解？為什么它們能承受住早該讓其它微生物化成一勺質(zhì)子和中子的加熱及珠磨研磨？它們細(xì)胞壁的成分真實(shí)其**的關(guān)鍵。真菌使用了葡聚糖和幾丁質(zhì)共同保護(hù)它們的細(xì)胞膜。幾丁質(zhì)加上鈣鹽也是昆蟲(chóng)外骨骼的重要成分，組成了甲殼動(dòng)物的保護(hù)盾。或者說(shuō)是生物水泥。




幾丁質(zhì)是乙酰葡糖胺通過(guò)β1、4糖苷相互連接聚合而成的。該結(jié)構(gòu)還能增強(qiáng)聚合物之間的鍵連接，早就了幾丁質(zhì)的仿生強(qiáng)度。（見(jiàn)左圖）

顯然這層細(xì)胞壁讓真菌熬過(guò)了每一個(gè)黑暗時(shí)刻。快速搜索真菌的進(jìn)化史不難找到很多有趣的信息，一句話總結(jié)下來(lái)，較早具有真菌特征的化石出現(xiàn)在原生代，約1430million年前。

回到本篇主題：教你如何提取真菌中的DNA和RNA。根據(jù)樣品類型，MOBIO提供多款試劑盒供選擇。

提取純培養(yǎng)的DNA和RNA

要提取純培養(yǎng)的DNA，我們建議使用含有玻璃研磨珠的PowerLyzer UltraClean Microbial DNA Isolation Kit配合機(jī)械研磨。實(shí)際上，需要一款強(qiáng)力的珠磨研磨機(jī)。渦旋儀也可以，不過(guò)我們建議在渦旋振蕩前對(duì)樣品進(jìn)行加熱水浴以增強(qiáng)破壁效果。對(duì)加入到含裂解緩沖液研磨珠套管的細(xì)胞進(jìn)行65-70℃水浴15min。如果你有類似于PowerLyzer這樣的強(qiáng)力珠磨研磨機(jī)，就可以省略加熱步驟，但仍需要評(píng)估研磨效果，不至于研磨過(guò)頭了。

要提取純培養(yǎng)的RNA，可試用UltraClean Microbial RNA Isolation Kit。這款試劑盒使用了碳化硅研磨珠，其擁有鋒利不規(guī)則邊緣，不但能很好裂解細(xì)胞，還能剪切基因組DNA分子。

我們有些客戶用PowerBiofilm DNA或RNA試劑盒也很成功。PowerBiofilm試劑盒中的化學(xué)試劑能溶解葡聚糖，破壞富含幾丁質(zhì)的細(xì)胞壁，使細(xì)胞較容易裂解。且PowerBiofilm試劑盒的研磨珠套管使用了不同大小的研磨珠混搭，能打碎更多細(xì)胞，尤其是純培養(yǎng)的菌絲。當(dāng)然富含抑制因子的環(huán)境樣品也能用PowerBiofilm試劑盒移除。

土壤中的真菌DNA、RNA提取

要提取土壤中的真菌部分微生物，我們建議用含玻璃研磨珠的PowerLyzer PowerSoil DNA Isolation Kit。玻璃研磨珠較適合強(qiáng)力珠磨研磨機(jī)。了解更多不同類型研磨珠與土壤DNA提取的關(guān)系，點(diǎn)擊這里。

要提取土壤RNA，較好的試劑盒是RNA PowerSoil Total RNA Isolation Kit。這款試劑盒結(jié)合了微生物RNA提取試劑盒的碳化硅研磨珠，還用上了基裂解緩沖液，確保微生物沒(méi)有生還機(jī)會(huì)。因?yàn)檫@款試劑盒樣品起始量是2g，讓你可以富集低微生物含量樣品的RNA。了解更多使用這款試劑盒的技巧，點(diǎn)擊這里。

水樣濾膜

當(dāng)然，如果你在用標(biāo)準(zhǔn)的47mm濾膜提取水樣，PowerWater DNA和RNA試劑盒就是你的可以選擇。

由此可見(jiàn)，樣品基質(zhì)類型與目標(biāo)微生物類型對(duì)選用試劑盒來(lái)說(shuō)同樣重要。

其它樣品類型:

你還會(huì)想到很多樣品類型：唾液、體液、血液培養(yǎng)物、棉拭子、糞便等等?；A(chǔ)答案就是，如果你有生物樣品需要提取真菌DNA或RNA，我們總有方法給到你。

還有非常多有趣且較其重要的真菌等待進(jìn)一步研究，MOBIO實(shí)驗(yàn)室有你需要的研究工具！

 


深圳市安必勝科技有限公司專注于試劑盒 實(shí)驗(yàn)室耗材等

• 詞條

  詞條說(shuō)明

• 科研小技巧：分光光度法與熒光染色法在定量檢測(cè)DNA應(yīng)用中的區(qū)別

  作者：Suzanne 來(lái)源：美國(guó)MoBio實(shí)驗(yàn)室【字號(hào)：大 中 小】 今天我準(zhǔn)備討論一種可能在你整個(gè)科研生涯中一直**的常規(guī)方法。它是如此的基本、簡(jiǎn)單，你可能根本沒(méi)在意。但我希望你在睡覺(jué)前能稍微想它一下。我要說(shuō)的是什么？當(dāng)然是質(zhì)粒提取。 質(zhì)粒DNA提取作為實(shí)驗(yàn)室常規(guī)實(shí)驗(yàn)，你肯定很希望就算提取過(guò)程出錯(cuò)了，依然能回收到DNA。但是，你回收到的真的僅僅是DNA嗎？事實(shí)上質(zhì)粒提取是對(duì)兩種定量檢測(cè)DNA

• 高通量提取- 96孔板振蕩器 使用指南

  ? ?? 你也在考慮高通量提取DNA/RNA嗎？很多在用我們MOBIO單管提取試劑盒的客戶希望擴(kuò)大樣本通量。我們也收到了很多客戶咨詢，例如高通量提取需要換用什么設(shè)備？提高通量意味著要將2ml單管替換成96孔板。盡管很多客戶已有使用96孔板的經(jīng)驗(yàn)，但大多數(shù)從來(lái)沒(méi)96孔板上的珠磨研磨。 絕 ? ?大部分MO BIO的試劑盒利用了珠磨研磨技術(shù)來(lái)幫助裂解細(xì)

• 磁珠法血液DNA/RNA的高通量提取

  作者：Michelle Tetreault Carlson 來(lái)源：美國(guó)MoBio實(shí)驗(yàn)室【字號(hào)：大 中 小】 兩個(gè)吸血鬼走進(jìn)酒吧并叫來(lái)酒保 "給我來(lái)杯血"，一個(gè)吸血鬼說(shuō)。 "給我來(lái)杯血漿"，另一個(gè)吸血鬼說(shuō)。 "好的"酒?；卮穑?一杯血和一杯軟血（Blood lite）！" (此處應(yīng)該有笑聲) 是的，我們?cè)趹c祝一個(gè)恐怖的季節(jié)，同時(shí)，也在此發(fā)布我們的新產(chǎn)品PowerMag Blood DNA/RNA

• 較快找到技術(shù)問(wèn)題的答案

  作者：Michelle Tetreault Carlson 來(lái)源：美國(guó)MoBio實(shí)驗(yàn)室 無(wú)論是不知道該選擇哪款DNA提取試劑盒還是提取操作上有問(wèn)題，MO BIO技術(shù)支持都可以幫到您。我們多半會(huì)遇到一些類似的問(wèn)題，可以很快給出答案。然而有時(shí)也是要耗點(diǎn)腦筋。通常是因?yàn)槲覀儧](méi)有足夠的信息來(lái)解決。此時(shí)，我們會(huì)寫郵件或回電話給您，詢問(wèn)更多細(xì)節(jié)（根據(jù)具體情況），我們可能會(huì)問(wèn)更多問(wèn)題。當(dāng)我們還在來(lái)回交流問(wèn)題時(shí)