探索地下微生物世界：尋找新的抗生素

時間：2020-01-05作者：深圳市安必勝科技有限公司瀏覽：590

作者：Suzanne kennedy 來源：美國MoBio實驗室

這個月我們采訪了明尼蘇達州州立大學藥物設(shè)計中心副教授Dr. Christine Salomon。
Dr. Salomon專注于化學與微生物生態(tài)學交叉領(lǐng)域，尋找具有長遠開發(fā)應(yīng)用潛力的新發(fā)現(xiàn)代謝產(chǎn)物。當花費大量經(jīng)歷研究地球表面生物，我們對地底下的生物世界卻知之甚少。Dr. Salomon調(diào)查研究了位于明尼蘇達州北邊的蘇丹礦山深入地下半英里的神秘微生物群。蘇丹礦山這個廢棄的鐵礦，已經(jīng)劃入了明尼蘇達州州立公園，成為新的待開發(fā)研究資源。

問：蘇丹礦山下的微生物生態(tài)與其它地下洞穴有什么不同？

答：當?shù)V山還開采的時候，礦工就打了大量的探孔尋找更多的鐵礦。隨著時間推移，地下水從周圍巖石通過探孔滲透到礦洞中，形成富鐵鹵水。進入礦洞后開始接觸含氧空氣并混入大量氯化鈣。前期采樣做微生物多樣性分析發(fā)現(xiàn)大量放線菌基因。而這種革蘭氏陽性菌正是生產(chǎn)多種抗生素和更多有趣物質(zhì)的來源。

問：你們的實驗室對這些微生物群落做了怎樣的調(diào)查？

答：去年夏天我們收到LCCMR 從環(huán)境與自然資源信托基金的撥款，培養(yǎng)從礦洞中收集到的樣品，并從這些菌株中發(fā)現(xiàn)了一些新的代謝產(chǎn)物。有趣的是，蘇丹礦山發(fā)現(xiàn)的大量放線菌種類非常接近于海底泥微生物。同時也發(fā)現(xiàn)這些微生物能夠生產(chǎn)出一些*一**的抗真菌組分。

問：做這些工作的意義有哪些？下一步有什么計劃？

答：目前*理想的抗真菌感染藥物種類非常有限，所以尋找新的抗真菌組分變得非常熱門。我們對這些新穎的代謝產(chǎn)物非常感興趣，希望開發(fā)出可用于人類疾病**的產(chǎn)品。同時，我們對蘇丹礦山中真菌與細菌之間的化學生態(tài)關(guān)系也非常感興趣。正與一位真菌微生物學家合作，準備再次進洞收集真菌樣品，研究其在礦洞環(huán)境下與其它微生物之間的微妙共生關(guān)系中扮演的角色。

問：Mo BIO的產(chǎn)品如何助力你的工作？

答：我們使用PowerSoil Kit來提取樣品微生物DNA并建立克隆庫。也用了BiOstic Bacteremia kit提取培養(yǎng)的放線菌DNA。試劑盒自帶的研磨珠裂解革蘭氏陽性菌非常高效，相對于傳統(tǒng)基因組DNA提取方法節(jié)省了大量處理時間。

 


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