NGS在應(yīng)用中面臨的主要挑戰(zhàn)

    NGS在應(yīng)用中面臨的主要挑戰(zhàn)

    雖然NGS在病原微生物的檢測(cè)中有著明顯的優(yōu)勢(shì),但是也依然面臨不少挑戰(zhàn):

    1、參考數(shù)據(jù)庫(kù)的完整性。微生物檢測(cè)鑒定的準(zhǔn)確性很大程度上取決于參考數(shù)據(jù)庫(kù)的范圍與完整性;

    2、臨床標(biāo)本的復(fù)雜性。臨床標(biāo)本來(lái)源復(fù)雜多樣,可能存在病原體信息太少而導(dǎo)致數(shù)據(jù)丟失或病原體數(shù)據(jù)混雜在正常菌群中難以區(qū)分;

    3、NGS測(cè)序技術(shù)的局限性。目前的分析質(zhì)量依賴于測(cè)序質(zhì)量、基因組組裝的質(zhì)量以及參考基因組序列的選擇和質(zhì)量;

    4、質(zhì)量控制和標(biāo)準(zhǔn)化。參考基因組的選擇,分型方法如何選擇等,目前尚未建立不同標(biāo)本測(cè)序前處理和參數(shù)設(shè)置的統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。

    NGS技術(shù)被認(rèn)為是一種較具應(yīng)用前景的實(shí)驗(yàn)技術(shù),盡管依然路途艱辛,但隨著測(cè)序成本的降低以及測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步,相比較于其他的檢測(cè)方法,NGS在病原微生物檢測(cè)行業(yè)的優(yōu)勢(shì)逐漸凸顯,必將成為臨床診斷的有力工具。目前國(guó)內(nèi)的基因檢測(cè)市場(chǎng)空間巨大,臨床醫(yī)師也越來(lái)越認(rèn)識(shí)到這項(xiàng)技術(shù)的**,加上目前初始階段的從業(yè)者們?cè)趨⒖紨?shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建等方面的持續(xù)耕耘,病原微生物基因檢測(cè)市場(chǎng)有較廣闊的空間亟待發(fā)掘。

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  • 詞條

    詞條說(shuō)明

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