化學(xué)計(jì)算軟件Spartan關(guān)于光譜的常見問題

時(shí)間：2023-10-17作者：北京環(huán)中睿馳科技有限公司瀏覽：49

今天睿馳科技團(tuán)隊(duì)精心為大家整理了化學(xué)計(jì)算軟件Spartan中關(guān)于光譜的六個(gè)常見問題。這些內(nèi)容旨在幫助用戶較好地理解和使用Spartan進(jìn)行光譜分析，涵蓋了從基本功能到復(fù)雜計(jì)算的各個(gè)方面。通過這些常見問題的解答，用戶可以較深入地探索化學(xué)光譜學(xué)，較有效地利用Spartan軟件進(jìn)行科學(xué)研究。




一、在頻率計(jì)算中使用了什么質(zhì)量？

默認(rèn)質(zhì)量可在 "MASS.spp "參數(shù)文件中找到（Linux 機(jī)器上為 "params.MASS"）。(默認(rèn)值是常見同位素的質(zhì)量。用戶可以使用 ISOTOPEMASS=AVERAGE 關(guān)鍵字或在原子屬性對(duì)話框中更改特定原子的同位素來覆蓋默認(rèn)值。




二、如果我改變一個(gè)原子的質(zhì)量，為什么頻率不會(huì)改變？

為了用不同的質(zhì)量重新計(jì)算“質(zhì)量加權(quán)Hessian”，必須重新提交工作。添加PROPRERUN關(guān)鍵字以強(qiáng)制屬性模塊在不重新計(jì)算能量的情況下重新運(yùn)行。




三、如何計(jì)算拉曼光譜？

拉曼光譜頻率的強(qiáng)度是通過分子相對(duì)于振動(dòng)模式的較化變化計(jì)算得出的。因此，這可能比計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)紅外強(qiáng)度（取決于偶較子的變化）要慢得多。需要注意的是，"輸出摘要 "中顯示并繪制在 RAMAN 圖表中的強(qiáng)度是按照激光頻率 [vo] 進(jìn)行縮放（可在選項(xiàng)菜單 -> 偏好設(shè)置 -> 設(shè)置對(duì)話框中進(jìn)行更改）、對(duì)數(shù)繪制并使用洛倫茲展寬的。

I(vi) = S(vi) * [ (vo-vi)4 ] / [ vi*(1-exp(vi*C2)/T)]。其中 C2 是 "*二輻射常數(shù)"；1.438777 cm-K。




四、什么是吸光度單位？

吸收的單位是每摩爾公里，km/mol。這個(gè)單位的理由可能會(huì)讓人驚訝，所以我們在這里推導(dǎo)這個(gè)單位。摩爾吸收系數(shù)e

e(v) = [1/Cd]log[Io(v)/I(v)] == A(v)/Cd

其中C是濃度，(mol/L)，d是路徑長度（cm），Io/I是強(qiáng)度比（無單位，入射光/透射光），'v'是波數(shù)（1/cm）。因此單位是[L/(mol*cm)]

但是，測量的是積分吸收A

A = ∫A(v)dv；在相關(guān)帶上

因此A的單位是[L/(molcm)][1/cm] == [1000cm3/mol*cm2] = 10m/mol。

乘以一百得到實(shí)驗(yàn)中和在Spartan中常使用的單位：1000m/mol = km/mol。




五、如何使用內(nèi)在反應(yīng)坐標(biāo)（IRC）方法？

Spartan可以使用三種方法生成反應(yīng)路徑。

一種簡單的方法是通過'能量輪廓'計(jì)算，它更改特定坐標(biāo)。（參見能量輪廓的討論。）對(duì)于當(dāng)反應(yīng)坐標(biāo)可以很好地表示為內(nèi)部坐標(biāo)（例如鍵距）的簡單系統(tǒng)，這個(gè)方法很有效。

反應(yīng)路徑也可以通過計(jì)算過渡狀態(tài)幾何和頻率計(jì)算來生成?？梢詾閷?duì)應(yīng)于反應(yīng)坐標(biāo)的單個(gè)虛構(gòu)頻率生成列表文件。

Spartan還實(shí)現(xiàn)了一種反應(yīng)坐標(biāo)算法，以給定的過渡狀態(tài)生成反應(yīng)路徑，使用Schmidt的算法。（M.W. Schmidt，M.S. Gordon，M. Dupuis，J. Am. Chem. Soc.（1985），107，2585）可以通過在執(zhí)行過渡狀態(tài)幾何計(jì)算時(shí)選擇IRC復(fù)選框來*。當(dāng)選中時(shí)，將生成一個(gè)包含反應(yīng)路徑的新文件。還應(yīng)選擇IR復(fù)選框。如果您知道有一個(gè)好的轉(zhuǎn)換點(diǎn)和一個(gè)好的Hessian，IRC可以作為一個(gè)單點(diǎn)“能量”計(jì)算與BE:IRC關(guān)鍵字一起運(yùn)行。

IRC計(jì)算耗時(shí)——建議用戶在重新提交IRC算法啟用之前，確認(rèn)已找到“好的過渡狀態(tài)”。確認(rèn)梯度很小，并且只有一個(gè)負(fù)的頻率。




六、如何很好地處理激發(fā)態(tài)？

Spartan提供了多種處理激發(fā)態(tài)的方法，這些方法的復(fù)雜性和成本各不相同。由于幾乎所有的基態(tài)都是單重態(tài)，而初始激發(fā)態(tài)幾乎總是較低的三重態(tài)，因此有一種簡單的方法是查看具有兩個(gè)未配對(duì)電子的“基態(tài)”。這幾乎總是“足夠準(zhǔn)確的”，并且比任一較**的方法都要快得多。

以苯為例，其基態(tài)已被優(yōu)化。這個(gè)單重態(tài)的HOMO-LUMO差為6.6電子伏特，這會(huì)是激發(fā)態(tài)能量的初始近似。這個(gè)分子被復(fù)制并粘貼在電子表格中，并以三重態(tài)的形式提交。這樣做了兩次，一次是三重態(tài)優(yōu)化，一次是在相同的單重態(tài)幾何形態(tài)下。從單重態(tài)到三重態(tài)的能量增益顯示在“Rel. E(eV)”列中（請注意**顯示的方程式）。單點(diǎn)能量將是熒光（垂直激發(fā)）的適當(dāng)數(shù)字，而三重態(tài)優(yōu)化將用于磷光。







注意，對(duì)于三重態(tài)優(yōu)化，使用IGNORESYMMETRY關(guān)鍵字關(guān)閉了對(duì)稱性，并勾選了IR框（變成了FREQ關(guān)鍵字），以確保找到真正的三重態(tài)較小值。任一負(fù)頻率都表明對(duì)稱性沒有被打破。




作為不同方法或者不同理論的一個(gè)例子，對(duì)基態(tài)單重態(tài)進(jìn)行了UV/Vis計(jì)算（使用UVVIS關(guān)鍵字）。還添加了KEEPVERBOSE和INCLUDETRIPLETS，如我們的幫助內(nèi)容中提到的。此外，因?yàn)楸绞且粋€(gè)困難的案例，意味著收斂性差，所以添加了UVSTATES=4。如果檢查詳細(xì)輸出，可以看到使用完整的TDDFT理論，激發(fā)態(tài)能量（垂直激發(fā)）是3.88電子伏特（TDA近似給出4.24電子伏特）。


北京環(huán)中睿馳科技有限公司專注于Prism數(shù)據(jù)分析軟件,SnapGene多少錢,EVS總代理,Mimics軟件價(jià)格,HYDRUS,GMS培訓(xùn),鉑金代理,軟件銷售,購買渠道等

• 詞條

  詞條說明

• 管道流體分析軟件Pipe Flow Expert新版本8現(xiàn)已推出

  Pipe Flow Expert是我們用于管道設(shè)計(jì)和管道系統(tǒng)建模的首要軟件程序。它計(jì)算具有多個(gè)供應(yīng)和排放罐、多個(gè)串聯(lián)或并聯(lián)泵以及多個(gè)管道尺寸和管件的開環(huán)或閉環(huán)管網(wǎng)中的流體流量。管道流量將計(jì)算每條管道中的流量，并計(jì)算整個(gè)系統(tǒng)中的管道壓降。新版本8現(xiàn)已推出，這是一個(gè)主要的版本新，具有重要的程序增強(qiáng)功能。在新版本8中可用以下功能：新孔板組件-孔板組件計(jì)算銳邊孔板圓形邊緣孔板斜面孔板厚邊孔板計(jì)算液體

• 北京睿馳科技積極開展消防領(lǐng)域仿真軟件售前售后服務(wù)工作

  近日，北京睿馳科技的技術(shù)服務(wù)工程師分別前往鄭州和東營，為河南省某設(shè)計(jì)研究院以及勝利油田提供熱情周到的消防領(lǐng)域仿真軟件售前售后服務(wù)。北京睿馳科技專注于PyroSim軟件的推廣與服務(wù)，該軟件具備引人注目的可視化FDS仿真模擬功能，能夠?yàn)橛脩籼峁┑统杀尽⒖焖?、?zhǔn)確的仿真體驗(yàn)。同時(shí)，Pathfinder軟件也是公司的重要產(chǎn)品，為用戶提供基于人員疏散的仿真模擬工作支持。在交流培訓(xùn)過程中，北京睿馳科技的技術(shù)工

• DigitizeIt軟件的應(yīng)用領(lǐng)域

  DigitizeIt在許多領(lǐng)域都有廣泛的應(yīng)用，主要涵蓋以下幾個(gè)方面：1.科學(xué)研究：DigitizeIt可以幫助科學(xué)研究人員從科技論文、期刊文章、實(shí)驗(yàn)圖像等中提取數(shù)據(jù)，進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和可視化。它可以用于各種學(xué)科，包括物理學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)、地學(xué)等。2.工程分析：在工程領(lǐng)域，DigitizeIt可以用于從技術(shù)手冊、工程圖紙、傳感器輸出等中提取數(shù)據(jù)，并進(jìn)行工程分析和建模。它對(duì)于數(shù)據(jù)采集、圖像處理和曲線擬合等

• 輕松掌握KaleidaGraph繪制柱狀圖的步驟與技巧

  柱狀圖是一種常用的數(shù)據(jù)可視化方式，能夠清晰地展示數(shù)據(jù)之間的比較和趨勢。在科學(xué)研究和數(shù)據(jù)分析中，掌握如何繪制柱狀圖是相當(dāng)重要的。本文將介紹KaleidaGraph軟件中繪制優(yōu)秀柱狀圖的基本步驟和技巧，幫助您快速掌握這一技能。導(dǎo)入數(shù)據(jù)：首先，在KaleidaGraph中導(dǎo)入您的數(shù)據(jù)。您可以從Excel、CSV或其他數(shù)據(jù)源中導(dǎo)入數(shù)據(jù)，確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和完整性。選擇圖表類型：在KaleidaGraph中，