SnapGene 日常分子生物學軟件

時間：2022-09-08

作者：北京天演融智軟件有限公司

SnapGene是可視化和記錄您日常分子生物學過程的較簡單的方法。

可視化

當您可以準確地看到自己在做什么時，克隆就較簡單了。

DNA可視化

查看DNA序列的多個視圖。

查看自動生成的DNA結(jié)構(gòu)的圖形歷史記錄。祖先序列可以作為單獨的文件恢復。

支持分析大型序列

瀏覽染色體大小序列。

利用SnapGene高效的數(shù)據(jù)處理能力掃描具有數(shù)千個注釋特征的大型DNA序列。

蛋白質(zhì)可視化

查看蛋白質(zhì)序列的多個視圖。

自定義區(qū)域、站點、綁定和序列顏色的顯示。

直觀的序列編輯功能

輕松編輯DNA和蛋白質(zhì)序列。

進行插入、刪除、替換和大小寫更改。復制和粘貼序列時，將自動轉(zhuǎn)換功能要素。

序列顏色編碼

將選定的DNA或氨基酸序列設(shè)置為這十種顏色其中之一。

為兩條DNA鏈或蛋白質(zhì)序列著色。顏色在“映射”和“序列”視圖中均可見。

功能注釋

自動標注常用功能，或手動標注新功能。

使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫查找DNA序列中的共同特征。您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫中。

模擬

SnapGene提供了美觀，信息豐富的窗口，可用于模擬各種常見的克隆和PCR方法。

限制站點指示器

確認限制站點適合克隆。

以粗體**顯示*特的限制性位點，或選擇自動定義Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。

限制性克隆

可視化克隆過程的所有細節(jié)。

如果您已經(jīng)有了一個克隆過程的想法，那么模擬將僅花費幾秒鐘。如果克隆過程存在設(shè)計缺陷，還可以捕獲并糾正錯誤。

PCR

模擬標準PCR。

使用您自己的引物，或要求SnapGene自動設(shè)計引物。產(chǎn)品文件將模板和引物存儲在其歷史記錄中。

重疊延伸PCR

重疊延伸PCR法融合片段。

較多組裝八個碎片。選擇要連接的片段及其定位，SnapGene設(shè)計引物。

引物定向突變

使用突變引物進行**突變。

選擇一個致突變引物，然后按一下按鈕查看修改過的質(zhì)粒。歷史色彩凸顯了這一變異。

Gateway克隆

模擬Gateway BP克隆或LR克隆，或同時模擬兩者。

為了方便，還提供了共同的供體向量和目標向量。選擇要組裝的片段，SnapGene即可設(shè)計引物。

Gibson組裝

通過融合較多8個片段，或?qū)⑤^多8個片段插入向量，模擬Gibson程序集。Gibson Assembly是一種流行的無縫克隆方法。

選擇要融合的片段及其方向，SnapGene即可設(shè)計引物。線性化后的載體可以通過酶切或反向PCR產(chǎn)生。

In-Fusion克隆

通過將較多八個片段插入一個載體來模擬Clontech的In-Fusion克隆。融合克隆是創(chuàng)建無縫基因融合的一種非常通用的方法。

選擇要融合的片段及其方向，SnapGene即可設(shè)計引物。線性化后的載體可以通過酶切或反向PCR產(chǎn)生。

TA和GC克隆

通過TA或GC克隆捕獲PCR產(chǎn)物。

選擇傳統(tǒng)的TA克隆或高效的GC克隆。

為了方便起見，提供了常用的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。

Annealing Oligos

將兩個寡核苷酸重組以形成雙鏈產(chǎn)物。

使用簡單控件為限制克隆添加懸挑。

避免錯誤

使用SnapGene，確保構(gòu)造符合您的要求，并確認您獲得了所需的序列。

基因融合閱讀框

確保構(gòu)造中的轉(zhuǎn)換功能位于框架中。

使用序列視圖可以查看兩個已翻譯的特征是否在框架中。

與參考序列對齊

使用功能強大的對齊工具檢查實際構(gòu)造是否與模擬構(gòu)造匹配。

請參見對齊序列與參考序列匹配的位置以及存在差異的位置的概述。

自動記錄

SnapGene自動記錄創(chuàng)建圖形歷史的操作，并將祖先構(gòu)造存儲在較終文件中。

全面的“撤消”功能

撤消幾乎所有操作。

不要覺得使用SnapGene文件很復雜--追溯這些步驟很容易。

歷史和嵌入原型序列

查看構(gòu)造的圖形歷史記錄。

單擊某個操作以**顯示父序列和產(chǎn)品序列的相關(guān)部分，或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。

單擊歷史樹中的原型以重新生成該原型序列文件，包括其注釋和克隆歷史。

歷史記錄顏色

使用可選的歷史記錄標上顏色來標識序列的較新更改。

查看有關(guān)組裝結(jié)構(gòu)的詳細信息，包括結(jié)扎的粘性末端。

擁有您的數(shù)據(jù)

SnapGene可以幫助您選擇讀取和共享文件，同時保持對數(shù)據(jù)的完全控制。

安全文件管理

把您的SnapGene文件放在您想要的地方。

使用您熟悉的、安全的計算機操作系統(tǒng)來存儲和管理SnapGene文件。

從其他格式導入

支持讀取許多常見的文件格式。

不僅可以導入DNA序列，還可以導入功能注釋和注解。

導出標準格式

將序列，圖譜或凝膠圖像轉(zhuǎn)換為標準格式，以與其他軟件一起使用。

將序列導出為GenBank或FASTA格式。將地圖或模擬的瓊脂糖凝膠導出為常見的圖像格式。

與SnapGene Viewer共享數(shù)據(jù)

將SnapGene格式的文件發(fā)送給同事或客戶，他們可以下載免費的SnapGene Viewer來瀏覽這些文件。

只需將文件連同鏈接發(fā)送到SnapGene Viewer。就像完整的SnapGene界面一樣，接收者將能夠看到圖譜、序列和注釋。

對于開發(fā)人員

如需將SnapGene整合到您的數(shù)據(jù)分析或?qū)嶒炇夜芾碥浖?，請?lián)系我們以獲取有關(guān)如何讀寫SnapGene文件的信息。

轉(zhuǎn)換文件格式

信息的公開交換至關(guān)重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了用于讀取和導出常用文件格式的選項。

從另一種格式導入時，目標不僅是捕獲DNA序列，還要捕獲注釋和注解。如果在導入文件時遇到故障，或者想要支持新的文件格式，請與我們聯(lián)系。

系統(tǒng)需求

SnapGene可適用于Windows和Mac系統(tǒng)。

北京天演融智軟件有限公司（科學軟件網(wǎng)）是 SnapGene 軟件在中國的授權(quán)經(jīng)銷商，為中國的用戶提供優(yōu)質(zhì)的軟件銷售和培訓服務(wù)。

詞條
詞條說明
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