游離DNA提取方法
時間:2022-04-10作者:南京兔牙生物科技有限公司瀏覽:672
游離DNA提取方法
【操作方法-離心法】
使用前先在Buffer W1和Buffer W2中加入無水乙醇,加入體積請參照瓶上的標簽。
1. 加1.44 mL Buffer L1至5 mL離心管中,并加入40 μL蛋白酶K。
2. 加入1.8 mL血漿或尿液樣本,蓋上管蓋,旋渦振蕩30秒,60℃孵育30min。
*如果尿液 體積不足1.8 mL mL,則必須補加生理鹽水使尿液體積達到1 mL。
3. 加入1 mL 異丙醇,顛倒混勻離心管3-5次,-20℃保存5-10min。
4. 將步驟3中的上清液倒入到核酸純化柱中(核酸純化柱置于2mL 離心管中),蓋上管蓋,12000 rpm 離心30秒,若體積過多,一次過濾不完,可重復該步驟,直至步驟3中溶液完全過完純化柱(不用更換過濾柱)。
5. 棄除濾液,將核酸純化柱置回到2mL 離心管中,在核酸純化柱中加入500 μL Buffer W1, 蓋上管蓋,12000 rpm 離心30秒。
* 確認在Buffer W1 中已經(jīng)加入無水乙醇。
* 濾液無須徹底棄盡,如果要避免粘附在離心管管口的濾液對離心機的污染,可將2mL 離心管在紙巾上倒扣拍擊一次。
6. 棄2mL 離心管中的濾液,將核酸純化柱置回到2mL 離心管中,在核酸純化柱中加入500 μL Buffer W2, 蓋上管蓋,12000 rpm 離心30秒。
* 確認在Buffer W2中已經(jīng)加入無水乙醇。
7. 棄2mL 離心管中的濾液,將核酸純化柱置回到2mL 離心管中,在核酸純化柱中加入500 μL無水乙醇, 蓋上管蓋,12000 rpm 離心1分鐘。
8. 棄2mL 離心管中的濾液,將核酸純化柱置回到2mL 離心管中,14000 rpm 離心3分鐘。
* 如果離心機的離心速度達不到14000 rpm,則用較高速離心4分鐘。
* 請勿省略該步驟,否則可能因所純化的核酸中混有乙醇而影響后續(xù)的PCR效果。
7. 棄2mL 離心管,將核酸純化柱置于一個潔凈的1.5 mL 離心管中,在純化柱中加入50-100 μL 60℃溫育的Buffer TE或水,蓋上管蓋,室溫靜置3分鐘,12000 rpm 離心1秒。
* 如果離心機沒有防泄漏的蓋子,請將離心條件改為8000 rpm離心1分鐘,以免管蓋脫落而損傷離心機。
8. 棄純化柱,洗脫的DNA可立即用于各種分子生物學實驗,或者將DNA儲存于-20℃?zhèn)溆谩?br>
【操作方法-真空抽濾法】
使用前先在Buffer W1和Buffer W2中加入無水乙醇,加入體積請參照瓶上的標簽。
1. 加1.44 mL Buffer L1至5 mL離心管中,并加入40 μL蛋白酶K。
2. 加入1.8 mL血漿或尿液樣本,蓋上管蓋,旋渦振蕩30秒,60℃孵育30min。
*如果樣本體積不足1.8 mL mL,則必須補加生理鹽水使樣本體積達到1.8 mL。
3. 加入1 mL 異丙醇,顛倒混勻離心管3-5次,-20℃保存5-10min。
4. 將過濾柱插入到真空泵系統(tǒng)的上,在過濾柱上放置20 ml的擴容管。
*保證補充管完全插入到過濾柱上,避免樣品漏出。
5、小心地將第3步得到的裂解液的混合液加入到在過濾柱上的擴容管中,打開真空泵。當所有的裂解液完全通過柱子后,小心取下補充管,丟棄。
*為了避免交叉污染,在相鄰的過濾柱間移動時務必小心操作。
6. 將500 μL Buffer W1加入到過濾柱中,保持柱子是打開狀態(tài),在所有的Buffer W1完全通過了過濾柱后。
7. 將500 μL Buffer W2加入到過濾柱中,保持柱子是打開狀態(tài)。在所有的Buffer W2完全通過了過濾柱后。
8. 將500 μL的乙醇(96–**) 加入到過濾柱中,保持柱子是打開狀態(tài)。在所有的乙醇完全通過了過濾柱后,關掉真空泵。
9. 關閉上過濾柱,從真空泵上取下。將過濾柱放置在一個干凈的 1.5 ml收集管中,全速(20,000 x g; 14,000 rpm)離心3 min。
10. 將過濾柱置于一個1.5 ml收集管中,打開蓋子,室溫干燥2-3分鐘。
11. 小心地將50–100 μL的Buffer TE或水加入到過濾柱膜*,蓋上蓋子,室溫孵育3 min。
注意:保證Buffer TE或水已經(jīng)平衡至室溫(15–25°C)。如果洗脫液體積比較小(<50 μl),那么應該將洗脫液加入到膜*,保證能完全洗脫結合的DNA。洗脫體積是可以根據(jù)下游的不同應用進行調(diào)整的。
12. 全速(20,000 x g; 14,000 rpm)離心1 min,洗脫核酸。
我們有*的游離DNA提取試劑盒,能對血液或者尿液中的游離DNA進行高效提取,陽性樣本小片段DNA(170bp左右)回收率測試在90%以上,每毫升血漿cfDNA得率為30-40ng,尿液20ng。由于在學校的課題涉及該方面,因此,通過該試劑盒對血漿或尿液樣本的抽提次數(shù)**過千次,抽提效果穩(wěn)定??蓾M足離心機或真空泵的提取。僅用于科研。提供相應的配套耗材。若有需要,可以留言聯(lián)系。
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詞條
詞條說明
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